Сектор за међународну сарадњу и европске интеграције обавља послове који се односе на: праћење, анализирање и усмеравање спровођења обавеза које проистичу из процеса приступања ЕУ, релевантним међународним организацијама, односно чланства у ЕУ и релевантним међународним организацијама, као и обавеза преузетих закључењем међународних споразума, протокола и иницијатива; учествовање у изради и хармонизацији закона и других прописа са прописима ЕУ, правилима, принципима, споразумима и стандардима релевантних међународних организација и међународних споразума; праћење, анализирање и предлагање мера за унапређење спољнотрговинске размене пољопривредних и прехрамбених производа са ЕУ, другим државама и регионима; припрема основа, платформи, докумената и информације потребних за преговоре и сарадњу са ЕУ, релевантним међународним организацијама, као и са другим државама и регионима; координацију активности у вези посета високих званичника и страних делегација на међународном нивоу; координацију активности на идентификацији потреба за међународном помоћи, представљању потреба и обезбеђивању међународне помоћи; програмирање и координирање пројеката финансираних из средстава донација и развојне помоћи, фондова ЕУ, као и билатералних и мултилатералних извора наменских средстава; координацију свих пројеката који се финансирају из средстава међународних финансијских институција у министарству и органима управе у саставу и друге послове из ове области.