Odsek za evropske integracije obavlja  poslove koji se odnose na: analizu i izradu osnove za pregovore o pridruživanju i  pristupanju EU u oblasti poljoprivrede i ruralnog razvoja, bezbednosti hrane, veterinarskih i fitosanitarnih pitanja i ribarstva i praćenje sprovođenja Sporazuma o stabilizaciji i pridruživanju; praćenje i analizu politika EU u oblasti poljoprivrede i ruralnog razvoja bezbednosti hrane, veterinarskih i fiotsanitarnih pitanja i ribarstva i pripremu mera za prilagođavanje politike u oblasti poljoprivrede i ruralnog razvoja bezbednosti hrane, veterinarskih i fiotsanitarnih pitanja i ribarstva politici EU; praćenje i analiziranje zakonodavstva EU, radi iniciranja promene postojećih i donošenja novih propisa i implementacije istih; učestvovanje u izradi i harmonizaciji zakona i drugih propisa sa propisima EU; predlaganje mera i aktivnosti za unapređivanje procesa pristupanja odnosno saradnje sa EU; praćenje, analiziranje i usmeravanje sprovođenja obaveza koje proističu iz procesa pristupanja odnosno članstva EU; priprema informacija i platformi za pregovore sa EU, i učestvovanje u pregovorima za pristupanje EU; komunikaciju, koordinaciju i saradnju sa drugim nadležnim državnim organima i službama Vlade, institucijama EU, međunarodnim organizacijama, diplomatsko – konzularnim predstavništvima Republike Srbije i drugih država; koordinaciju rada unutrašnjih jedinica i organa uprave u sastavu Ministarstva i pružanje stručne pomoći u procesu pristupanja EU.